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clusterProfiler是一个功能强大的R包,同时支持GO和KEGG的富集分析,而且可视化功能非常的优秀,本章主要介绍利用这个R包来进行Gene Ontology的富集分析。
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GO分析的操作这里就不再赘述了,网上有很多相关的帖子,基本上常规的物种用clusterProfiler包就可以解决了。今天我想来谈谈如何可视化GO分析的结果。对于GO富集结果的可视化,最常见的就是用条形图和气泡图来展示部分关注的条目。
GO、KEGG富集分析是我们做生信分析较为常用的部分,它可以将基因与功能相联系起来。GO指的是Gene Ontology,是基因功能国际标准分类体系。
在使用Grafana展示数据前,我们先来熟悉Grafana的各个功能菜单的用途。为方便记忆,现将菜单栏各项功能编号为1-11,如下图所示。
其中default是我们前面设定的默认数据源;Prometheus是我们添加的数据源;Grafana则用于需要查询Grafana自身状态时使用; Mixed用于需要从多个数据源中查询和渲染数据的场景;另外一个Dashboard不清楚了。这里我们选择Prometheus作为数据源。
Table Panel也是Grafana的原生插件。Table Panel支持将基于时间序列的多种数据以表格式形式展示,Table Panel灵活且相对复杂。Table Panel配置 ① Data,包括Table Transform(表格转换)和Columns。
grafana监控展示界面,在我们获取到监控数据后,可能需要把数据展示出来,给领导们邀功。grafana就是这样一款软件,开源免费,模板丰富。可直接对接zabbixprometheus和mysql数据库等。钉钉机器人。
Stat Panel是grafana的原生插件。目前在Grafana的7版本中仍还处于beta版。Stat Panel功能与Singlestat Panel功能差不多,同样可以使用阈值控制背景颜色或值颜色。区别是Stat Panel支持多值展示。
1、go严格上说没有多态,但可以利用接口进行,对于都实现了同一接口的两种对象,可以进行类似地向上转型,并且在此时可以对方法进行多态路由分发。
2、这节课的难度是先浅后深,会先讲解基础理论,然后再进行实战。我觉得理论方面比较惊艳我的是把java,go,python三个语言对比来讲,非常精彩,受益匪浅。
3、慕课网的GO语言工程师这门课是不错,知识内容也足以匹配P6级的岗位技能,但是师傅领进门修行在个人,你得下功夫好好学才能有好结果,不是说看完就P6了。