Linux运行sql脚本的具体操作步骤如下：
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1、使用shell工具登陆到安装postgresql的服务器，切换到postgres用户，postgresql默认的操作用户，命令是：su - postgres，查看当前路径是/var/lib/psql，创建一个test.sql脚本文件，命令是：vim test.sql。
2、sql脚本内容是：create table test (id int not null primary key,name text);insert into test valus(1, 't1');
3、执行test.sql脚本，命令是：psql -f test.sql
这里是因为postgresql安装本机上，在第一步中我们切换到了postgres用户，因此这里默认就是postgres用户来操作，不用带上用户名和密码。执行结果如下，可以看到有两个提示：
create table
insert 0 1
执行完成后，我们登入数据库，命令是：psql
4、进入psql交互式命令行后，我们执行两个查看命令：\d
可以看到表test确实已经创建成功，然后执行命令：\d test
可以看到表中字段是id和name，和我们创建语句中内容一样，说明第一条语句执行成功。
5、查看表中数据，命令是：select * from test;
显示出来的值是1，t1，说明第二条执行语句也执行成功，说明test.sql脚本执行成功。
6、默认是postgres用户，本机操作是，不需要用户和密码，现在我们来试试操作远程linux服务器上的postgresql，也就是说执行本地的脚本文件，在远程服务器上创建表。如下面图中所示，命令是：psql -U test1 -h 192.168.1.194 -f test.sql，输入对应用户的密码。
7、登陆到这个远程服务器上，命令是：psql -U test -h 192.168.194
执行查看命令：\d，\d test
最后查询数据库：select * from test;结果和上面都一致。
Linux cp命令主要用于复制文件或目录
1.语法
2.参数说明
3.案例
3.1. cp 命令基本用法
3.2 复制目录
3.3 复制软链接文件
3.4. 保留源文件属性复制
3.5. "-l" 和 "-s" 选项
4.cat
6.linux快速删除大量文件
沿着前面的轨迹，接下来是Linux中shell脚本的学习。这对于生信工程师后续处理大量 (海量更合适些) 数据是非常非常重要的，但是同样的，作为一个有点古板的人，对于"脚本"是什么意思我都死磕了好久。主要觉得有些抽象，尤其是跟生信的同事讨论项目分析部分的问题时，他们经常会说道这个词，在他们意识里这是个不言自明的术语，殊不知对外行人而言 (比如我)，那简直就是无情的"知识的诅咒"。经常是我假装听懂了，然后继续讨论下面的问题，形成一个模糊的印象。
百度上的解释是：脚本（Script）是一种批处理文件的延伸，是一种纯文本保存的程序，一般来说的计算机脚本程序是确定的一系列控制计算机进行运算操作动作的组合，在其中可以实现一定的逻辑分支等。不知道你能不能看懂，反正我开始的时候真是一知半解。
鸟哥私房菜的解释是：shell script是利用 shell 的功能所写的一个"程序"，这个程序是使用纯文本文件，将一些shell的语法与命令(含外部命令)写在里面，搭配正则表达式、管道命令与数据流重定向等功能，以达到我们所想要的处理的目的。不明觉厉，好像更看不懂了···
Jude 的简单粗暴大白话解释是：脚本就是Linux中很多命令按照一定规则的组合，以实现某个特定的功能。Linux中有很多简单的命令，往往只是进行了简单的对话，比如 cd 就是进入到某个目录，简单直接。但是如果我想进入某个目录A，然后在目录A中创建目录B，再在目录B中创建文本C呢？当然可以一步一步操作，如果想要一步到位呢，那就可以用脚本，把三个命令写在一起，一起执行。好像有点啰嗦···
或者从英语的角度去理解，脚本的对应英文是Script，而这个单词的中文释义中还有剧本的意思。剧本就好理解了啊，剧本就是导演(生信工程师)基于某个主旨(要实现的目标)按照一定的手法(规则)所写的一个故事。不管是哪个演员，都得按照剧本演。所以，学好英语对于生信也是有帮助的~
按照脚本的复杂程度可以分为：
这个无需多说，其实就是若干个简单命令的顺序排列，执行脚本后会按照命令的前后关系从前往后一一执行。
相对于简单的基本脚本，结构化的命令脚本可以施加逻辑流程控制，从而改变程序(命令)执行的顺序。基本脚本中的命令就是从上往下执行，但是结构化的命令脚本可以根据逻辑判断重复或者跳过某些命令。
常用的结构化命令(语句)有：
后面还有什么嵌套循环啊啥的，不过我觉得上面的7中命令学到家了，应该可以应付大部分在生信分析里面的应用了。
记得高中的时候，物理老师(也是班主任)在给我们讲解习题时有个有意思的套路：不管什么难题现在下面写个"答："，以示自己解决问题的决心，也是一种正向的心理暗示。脚本编写也是有套路的，不过总的来说还是比较简单。
对于简单的脚本(超级简单的那种)，直接几个命令连在一起即可，中间用"；"隔开。
对于更长更复杂的脚本，一般需要创建一个文本，并在里面编辑。这就涉及到了文本编辑器，比较常用和简单的一般有nano和vim，实在很简单，规则也容易理解，教程随手可得，不多说。
比如用vim创建了一个脚本之后，具体的语法(套路)：
ok，脚本写完了，怎么让脚本开始工作呢？这有涉及到之前讲过的环境变量和相对路径、绝对路径了。方法有三：
就这么多吧，应该有点感觉到了，剩下的就是狂练狂练了~
