linux常用命令： pwd命令 该命令的英文解释为print working directory(打印工作目录)。输入pwd命令，Linux会输出当前目录。 cd命令 cd命令用来改变所在目录。
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linux常用命令及用法包括登陆、重启、关机、添加／删除用户、切换用户等。登陆 ＃和＄ ＃表示为root用户，＄表示普通用户。
top：显示当前进程的系统资源使用情况。kill：终止指定的进程。chmod：修改文件或目录的访问权限。chown：修改文件或目录的所有者。su：切换用户身份。sudo：以超级用户权限执行命令。tar：打包和解压缩文件。
其他有用的命令包括cp、mv、rm和chmod。cp命令用于复制文件和文件夹。mv命令用于移动文件和文件夹。rm命令用于删除文件和文件夹。chmod命令用于更改文件和文件夹的权限。在使用linux时，还有一些高级命令需要了解。
在Linux系统里常用于文本查看、操作、统计的命令：通过多敲键盘，形成手感 肌肉记忆 ，熟练掌握这些命令，在以后生信分析中游刃有余。
1、mkdir 作用mkdir命令的作用是建立名称为dirname的子目录，与MS DOS下的md命令类似，它的使用权限是所有用户。 格式mkdir [options]目录名[options]主要参数-m，--mode=模式：设定权限模式，与chmod类似。
2、linux常用命令如下：查看内核版本：uname-a。控制台-》图形界面：init5或者startx。图形界面-》控制台：init3或者直接注销。如何查看ip地址：ifconfig。配置ip：ifconfigeth0ip地址。
3、文件处理命令：file、mkdir、grep、dd、find、mv、ls、diff、cat、ln。系统管理相关命令：df、top、free、quota、at、lp、adduser、groupadd、kill、crontab。
4、系统管理相关命令：df、top、free、quota、at、lp、adduser、groupaddkill、crontab、tar、unzip、gunzip、last。网络操作命令：ifconfig、ip、ping、netstat、telnet、ftp、route、rloginrcp、finger、mail、nslookup。
5、bash常用任务管理命令 &，Ctrl-Z，Ctrl-C，jobs，fg，bg，kill等。 基本的文件管理命令 ls， ls-l， less， head， tail， tail -f， ln， ln -s， chmod， chown， du， du -sk *，df， mount等。
6、学习Linux系统，命令是最基础的一部分，有着很重要的地位，所以入门必须掌握好常用命令。
1、语法：telnet [-8acdEfFKLrx][-b][-e][-k][-l][-n][-S][-X][主机名称或IP地址]补充说明：执行telnet指令开启终端机阶段作业，并登入远端主机。参数：-8 允许使用8位字符资料，包括输入与输出。
2、图1：Xshell软件主界面 步骤二 执行新建命令。打开Xshell软件后找到左上角第一个“文件”菜单并单击，弹出来一个下拉框，点击选择“新建”命令（或者直接按下快捷键“Alt+n”）。
3、知道linux的ip，用户和密码就可以远程登陆了。在你的SSH 客户端会有一个linux的终端。在这执行命令就可以了。
