网创优客建站品牌官网
为成都网站建设公司企业提供高品质网站建设
热线:028-86922220
成都专业网站建设公司

定制建站费用3500元

符合中小企业对网站设计、功能常规化式的企业展示型网站建设

成都品牌网站建设

品牌网站建设费用6000元

本套餐主要针对企业品牌型网站、中高端设计、前端互动体验...

成都商城网站建设

商城网站建设费用8000元

商城网站建设因基本功能的需求不同费用上面也有很大的差别...

成都微信网站建设

手机微信网站建站3000元

手机微信网站开发、微信官网、微信商城网站...

建站知识

当前位置:首页 > 建站知识

r语言go气泡图 r语言pam

R语言GEO数据挖掘:步骤四:富集分析KEGG,GO

3 GO富集分析 加载了注释库之后,读取基因列表文件,并使用clusterProfiler的内部函数enrichGO()即可完成GO富集分析。读取基因列表文件,并使用clusterProfiler的内部函数enrichKEGG()即可完成KEGG富集分析。

为昭阳等地区用户提供了全套网页设计制作服务,及昭阳网站建设行业解决方案。主营业务为成都网站设计、网站建设、昭阳网站设计,以传统方式定制建设网站,并提供域名空间备案等一条龙服务,秉承以专业、用心的态度为用户提供真诚的服务。我们深信只要达到每一位用户的要求,就会得到认可,从而选择与我们长期合作。这样,我们也可以走得更远!

前景基因:指的是我们所要进行富集的基因,一般是基因的ID 背景基因:指的是前景基因在某个基因集合进行富集,这个基因集合就是背景基因 描述信息:每个GO的Term的属性,或者是每个KO号或者map号的属性。

安装clusterProfiler:对于没有转换的gene ID,clusterProfiler也提供了 bitr 方法进行转换ID:可以看到,这里转换ID的对应文件来源于org.Hs.eg.db这个包。

把他设置成100,让我们的标签可以一行展示。是不是还是原来的配方,还是熟悉的味道 同样的柱形图,我们也能让他恢复原来的容貌。

scale_y_discrete则调节label过长的情况,让图片看起来 更美观。3)检查结果,可见geneID展示为gene symbol。(1)在enrichGO函数中,设置readable = TRUE;(2)用setReadable函数,对GO或者KEGG结果进行转化即可。

如何用R语言画气泡图

坐标为x,y的点图 点的size 用另一变量Z控制。

然后,我们来看一看用常见的包ggplot2应该如何做该图。 首先我们要对数据处理一下,剔除一些不必要的信息:稍作改变,去除图例添加facet。

可以画出气泡图的R函数有symbols。绘制气泡图主要使用函数symbols(x,y,circle=r).当中x、y是坐标轴,r是每一个点的半径。

如何使用R语言的ggplot2包画气泡图

1、坐标为x,y的点图 点的size 用另一变量Z控制。

2、然后,我们来看一看用常见的包ggplot2应该如何做该图。 首先我们要对数据处理一下,剔除一些不必要的信息:稍作改变,去除图例添加facet。

3、ggplot2画图必要部件-数据,映射和几何对象1 数据数据(Data)用于画图的整洁数据library(tidyverseggplot()先只提供数据,创建一个空图形。# ggplot()先提供整洁数据,生成一个空图形2映射映射,把数据变量集与图形属性库建立关联。


分享标题:r语言go气泡图 r语言pam
当前地址:http://bjjierui.cn/article/deosohi.html

其他资讯