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虚拟主机选择哪个操作系统管理，从表面上看，似乎是在 Linux或Windows 之间二选一即可。然而却复杂得多，因为Linux以多种发行版的形式出现，每一个发行版本都与Linux操作系统的工作方式略有不同。
Windows 系统
服务器版本很类似，因此它与Linux相比大的优点之一就是它学习曲线非常低，可以很容易配置。
Linux 系统
有各种各样的发行版本，这可能会让初学者很困惑。开发不同的发行版本的原因是，不同的人群在使用计算机时有不同的目标，发行版可能要求使用不同的预装软件集来安装Linux。在操作系统的配置方式上也常常存在差异。
Linux发行版优势是，发行版中通常包含各种各样的软件。软件通常是从存储库（从概念上讲有点像应用商店）安装的，在存储库中，软件由发布后的团队成员管理和维护，以确保所有软件都能正常工作。从存储库安装的软件将在Linux发行版的支持生命周期内获得安全更新，但不会升级到较新的版本，以确保不会发生任何中断，这些更新可以自动安装。
Linux的缺点是，它的配置是在基于文本的命令行中完成的，这对于任何在九十年代中期之前开始使用计算机的人来说都是一种模糊又熟悉的概念。对于那些习惯于用鼠标在图形界面上控制一切的新用户来说，这可能是一个相当大的障碍，因为命令行缺乏通过单击菜单和选项来学习软件工作方式的一般提示。
另一方面，互联网上有很多关于网站空间执行任务的指南和教程。为了使配置Linux服务器更容易，已经发布了许多网络控制面板，其中一些是免费的，而另一些则需要每月支付一笔许可费。
总之，如果想使用一些熟悉的学习曲线最小的操作系统，也不在乎这笔许可费，那么选择Windows系统。如果预算很紧，并且宁愿将许可费用投入到更强大的服务器上，那么linux主机将是一个很好的操作系统。如果对界面和学习曲线没有太多要求，Linux主机是个理想的选择。
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