下面的语句有错：
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$coord[] = 1;
因为是二维数组，不能赋值1，应该修改为：
$coord[$c] = Array();
赋予一个空数组的值
此外你这个代码看起来是C的思路，PHP不是这么搞的，这样写代码就失去了PHP的优势。
PHP给二位数组赋值的方式是非常灵活的，这里介绍三种方法（设二位数组$arr = array(array(1,2,3),array(4,5,6));）：
在已知二维数组元素个数的情况下，可以直接根据下标来赋值：
$arr[2] = array(7,8,9);// 给二维数组的第一维赋值。
$arr[3][0] = 10;// 给二维数组的第二维元素赋值。
2.在未知二维数组具体元素的情况下，可以使用array_push()函数来赋值：
array_push($arr,array(11,12,13));
3.同样，在未知二维数组元素的情况下，还可以利用count函数来赋值：
$arr[count($arr)] = array(14,15,16);
你例子中的代码我并没有看出有什么需要二维数组的地方，两个一维数组就行了啊。我写给你看一下
$szx = array();
$szy = array();
$sql = "select x, y from data";
$res = mysql_query($sql);
while($row = mysql_fetch_array($res)) {
$szx[] = $row['x'];
$szy[] = $row['y'];
}
$arrxjs = json_encode($szx);
$arryjs = json_encode($szy);
至于你的代码的问题如下
$sql6="select x,y from data ;"; 里面最好不要有分号， $sql6 = "select x,y from data";就行了
mysql_query($sql6); 你写成了mysql_query($res6)
$szx[i][] 应该修改为 $szx[$i][];
array_push($szx[$i], '值') 和 $szx[$i][] = '值' 是等价的，因此你连用它们会导致$szx变成三维数组，正确为array_push($szx[$i], $row['x'])或者$szx[$i][] = $row['x'];
$arrxjs和$arryjs只要在while循环外执行一次就行了
for循环没什么意义吧，我没看到你使用$j啊。或者你贴的代码不全
select *,DATE_FORMAT(add_time,'%Y-%m-%d') as add_date from donku_articles
把sql语句改成上面这种，另外最好不要用fetch_row这种索引方式取值，可以用fetch_assoc这种关联的方式，
另外你的这个 貌似在while里面用不到foreach,,smarty引擎我没用过，按理说它的赋值 应该也不用while一个一个赋值，把$smarty-assign('art_recommend_row',$new_result);这个赋值拿到循环外面(smarty没用过，按照thinkphp yii2 这些框架来说 赋值给模板不需要放在循环里面)，我按照我的想法把你的改了一下
include('includes/init.php');
$sql="SELECT *,DATE_FORMAT(add_time,'%Y-%m-%d') as add_date FROM `donku_articles`";
$query=$mysql-query($sql);
$result=[];
while($row=$mysql-fetch_assoc($query)){//这里应该是关联的形式，从你的fetch_row我猜是应该是fetch_assoc
$result[]=$row;
}
//下面是赋值给模板
$smarty-assign('art_recommend_row',$result);
