在Linux系统里常用于文本查看、操作、统计的命令：
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通过多敲键盘，形成手感 肌肉记忆 ，熟练掌握这些命令，在以后生信分析中游刃有余。以下是每个命令的详细的介绍（主要是跟着 生信技能树小郭老师 学习做的笔记）
接下来通过示例把10个命令的常用参数和用法展示出来：
参数的用法介绍：
注意事项：
用 cat 命令可以 查看文本 ，也可以 编辑文本 ，编辑文本要加 符号，退出时，另起一行，按 control C 退出
zcat可以查看压缩的文本文件，tac逆向查看
结合 管道符| 使用
head / tail -n :查看文件的前 / 后 n 行，默认 10 行 （在R语言里head和tail默认是前6行）。
less命令用得最多 ，more命令用得比较少
3.1 less命令
less [参数] 文件名
less命令重要的补充用法1 ：
需要注意 退出 ：只要使用less命令， 按q键
less命令重要的补充用法2 ：
参数用法：
less命令 不加参数 查看文件：
less命令加 -N参数 查看文件：显示行号
less命令加 -S参数 查看文件：单行显示，非常规整
对比：less和cat命令显示文本行号的用法：less -N，cat -n
3.2 more命令
**more ** 逐页查看，按空格翻页，按回车换行 ，more命令一般很少用，熟练掌握less命令就好
查看压缩文件
wc 统计字符是也把换行符统计进去，但是别的命令不一定会把换行符算进去，。
常见参数:
切记：用less命令，按q退出
cut命令是按关键词来切的
常见参数:
排列前：
排列后：
解释：1和0比，1大；7和0比，7大…在sort字典排序里，100816比1737小，所以100816排在前面。
命令行查看一个表格结构时，因为制表符对齐的原因，出现一个错位的现象。还有 字典排序 可能和我们平时的认知不一样，所以 加上-n参数 ， 让数值有数学意义上的大小来排序 。
uniq命令去重，只有两行出现重复，而且是相邻的两行，如果不相邻，即使出现两行一模一样，不会去重。
uniq命令通常和sort命令搭配使用
换其它文件试试
总之，uniq命令使用时经常和sort一起
常见参数:
常见用法1：
paste file1 file2
-s :按行合并 演示
常见用法2 : paste - -
常见参数:
要养成一个好习惯，原始数据不要轻易修改，修改的东西另外保存，文本保存用 (重定向)或是 (追加)
1. 用 less 查看 example.gtf ，然后管道符传递给 wc
2. 截取 example.gtf 第 9 列的内容
3. 在第2步的基础上截取分号分割的第1列
4. 在第3步的基础上排序、去重复并统计
5. 在第4步的基础上，将空格替换成制表符
补充小知识 ：
清屏 ：control L
查看历史（输入过的）命令 ：history
我们在linux系统下面经常需要编辑并保存文件，那么如何操作呢？下面我给大家分享一下。
工具/材料
linux系统
01
首先进入linux系统以后右键单击桌面，选择Open In Terminal选项，如下图所示
02
接下来在弹出的终端命令行界面中通过vi命令打开要编辑的文件，如下图所示
03
进入编辑器以后我们按下insert键进入插入模式，如下图所示，这时可以编辑内容
04
最后编辑完内容以后按ESC键退出编辑模式，接着按冒号键，然后输入保存并退出，如下图所示
vi 文件
i在当前光标插入
o在下一行插入
ESC退出编辑模式后wq保存退出
1.如图，vi 文件名，接着按回车即可打开对应的文件，如果没有对应的文件，那么vi命令就会自动创建一个新的。
2.如图，vi打开文件后是命令模式状态，要用i或者a命令才可进入可编辑的状态哟。这里我就按a进入了编辑模式了哦。
3.如图，在编辑模式的情况下敲完内容，这个时候就应该保存文件了。保存文件要按esc，这样就会退回vi的命令模式喔。
4.按完esc后输入冒号（英文的），然后就转换到了末行模式了，末行模式决定是否保存文件。
5.如图所示，末行模式下可以按x来保存，x命令可以保存编辑好的文件哟。
6.也可以用到wq来保存，如果是q!则不保存哦，这点要自己谨记在心，这里我就保存一下vi编写的文件。
7.然后查看，查看用到了cat 文件名哦。
8.如图所示，vi编写的内容可以看到，这表明保存成功。
1、linux保存并退出命令。
2、linux命令行保存并退出。
3、linux中保存退出和不保存退出的命令。
4、linux退出命令。
1."linux保存并退出命令，为您提供linux保存并退出命令图文信息，先按键盘上面的ESC按键，接着输入冒号，然后再输入wq并回车即可保存退出，另外只输入冒号和q为不保存退出，而输入！q为强制退出，！wq为强制保存退出。
在linux终端下用命令编辑一个文件并保存的具体操作步骤如下：
1、首先打开命令控制台找到要编辑的文件，执行命令ls看看下面有几个文件，我这个下面有个index.php文件。
2、然后执行命令vi index.php。
3、这个时候如果想修改这个文件的内容，按下间键盘上的'i'键，最下方就会变成INSERT，就可以修改了。
4、写个echo的代码进行保存 Esc+:+wq 这个是保存，回车保存。
5、保存完成以后，再次打开这个文件会发现刚才写入的代码已经保存到里面了。
6、不保存的命令Esc+:+q!，通过以上步骤即可实现在linux终端下用命令编辑一个文件并保存。
