这个是覆盖不了的，你必须要将原来安装的程序卸载掉，就像我以前安装SQL 2000的时候，只要第一次出错，第二次安装就安装不上，只有去注册表里面将你所安装的原来的程序卸载掉。
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不适用clickonce的话，需要建立一个打包工程。制作安装界面。
也可以使用第三方的一些工具。无非就是部署debug文件夹中的内容。
打包的具体操作步骤：
1）新建“安装和部署项目”-- “安装向导”
2）选择菜单中 项目-- 添加-- 文件（这里选“创建用于windows应用程序.exe你的数据库文件”）-- 打开
3）一般会自动将依赖项添加到“检测到的依赖项”，如果没有，那么我们要手动将其加入4）
Crystal_Managed2003.msm （如果有水晶报表）
dotnetfxredist_x86.msm （.net一定是必须的）
... （如果有引用其他的dll）
4）手动加入要包含的文件：项目-- 添加-- 合并模块（添加你的程序文件） (包括dotNetFramework和MDAC27)
位于：C:\Program Files\Common Files\Merge Modules\ 下
具体功能如下：
（托管组件 MSM 处理所有托管组件的分发，其中包括 Windows 窗体查看器、Web 窗体查看器和所有 Crystal Decisions 命名空间）
* Crystal_Managed2003.msm、
Crystal_Managed2003_chs.msm、
（对于使报表运行所需的所有其他文件，由数据库访问 MSM 处理其分发。其中包括数据库、导出和图表驱动程序。）
* Crystal_Database_access2003.msm、
Crystal_Database_access2003_chs.msm、
（KeyCode MSM 处理 Crystal Decisions 密钥号码的安装,注意是添加合并模块，否则没有“MergeMouduleProperties”属性）
* Crystal_regwiz2003.msm、
（是vc的运行库，估计是Crystal Report或涉及到的某些程序是用vc写的，所以需要它！）
VC_User_CRT71_RTL_X86_---.msm、
VC_User_STL71_RTL_X86_---.msm、
5）打开解决方案-- 右键点击Crystal_regwiz2003.msm的属性，在“MergeMouduleProperties”里的“License Key”填入：AAP5GKS0000GDE100DS（这个是你生成Crystal Report是用到的注册号的密码！）
6）生成解决方案（或直接按Ctrl+Shift+B）
至此整个分发程序已经做好，再把刚才做的那个安装程序双击一下……
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打包时加入卸载功能：
方法一:
1.在打包项目中添加文件msiexec.exe(一般可在c:\windows\system32\下找到)
2.在文件系统视图中选择应用程序文件夹,在msiexec.exe上按右键,选择创建快捷方式,重命名快捷方式为 "卸载 ".
3.更改此快捷方式的Arguments 为 "/x {产品id} ",产品id的值为打包项目的ProductCode属性值.
方法二:(推荐)
1.先生成安装包，记下ProductCode,下面要用到
2.用VS.net建立一个新的控制台程序uninst.exe文件
'power by: landlordh
'for 2000,xp,2003
Module uninstall
Sub Main()
Dim myProcess As Process = New Process
If System.Environment.OSVersion.ToString.IndexOf( "NT 5 ") Then
myProcess.Start( "msiexec ", "/X{2B65D4A9-C146-4808-AB4B-321FB0779559} ") '改为自己的ProductCode
End If
myProcess.Close()
End Sub
End Module
3.将控制台程序BIN目录的exe文件加入到打包程序文件中,在程序组创建uninst.exe的快捷方式
如果装个ms的控件的话，则直接把framework和msac打在包里。
打包过程：
1、打开自己已经创建好的VB.NET项目（一般一开始创建项目的时候创建的是Windows窗体应用程序）。
2、点“文件”--“新建项目”--“其他项目类型”--“安装部署”--“Visual Studio Installer”--“安装项目”，输入项目名称（此处命名为setup1）并点击“确定”。
3、执行完上一步，在解决方案下面会出现setup1项目。右击setup1项目--“添加”--“项目输出”。
4、在“添加项目输出组”中，选择“主输出”，然后单击“确定”。将自动添加所有依赖项。
5、在解决方案资源管理器中，右击安装项目---“添加”---“合并模块”。 把相关模块添加进来。
6、在文件系统选项卡中添加所需的应用程序图标等文件，并生成应用程序的桌面快捷方式，在快捷方式上右键选择属性，并在属性栏中的图标处选择应用程序快捷方式图标。（要在用户桌面和用户的“程序”菜单属性里将AlwaysCreate属性的值修改为True）。这样安装完程序后就可以看到桌面的图标了
7、关于应用程序图标的详细说明：
（1）点击“应用程序文件夹”并在右侧的列表中的“主输出来自。。”上右键然后点击“创建主输出来自。。的快捷方式”
（2）把生成的快捷方式复制到“用户桌面”，然后右键重命名为你想要在程序安装后显示的名字。
（3）重命名完成后在右侧的属性栏中点击图标设置为自己想要的图标，注意，需要先把图标文件ico加入到“应用程序文件夹”中。（ico的制作：先做好256*256的png文件，然后百度ico制作找到在线制作ico的网站，直接生成ico图标文件）
关于安装后的一些属性的设置：
1.可以直接生成软件，生成后在bin目录下面，可以直接打开使用。
2.也可以发布到网络盘，推荐这个，你更新后使用软件的人打开也会提示更新
